Johtokunnassa on pysyvinä asiantuntijoina kolme maatalouden rakennetuista annetun lain (1476/2007) mukaisia lainoja myöntävien luottolaitosten edustajaa sekä enintään kolme maa- ja metsätalousministeriön, Ruokaviraston tai elinvoimakeskusten virkamiestä.

Johtokunta valitsee yhden tai useamman sihteerin, joiden tulee olla maa- ja metsäta-lousministeriön tai Ruokaviraston virkamiehiä.