Kansliassa on ne virat, jotka eduskunnan virkamiehiä koskevien säännösten nojalla on kansliaan perustettu. Lisäksi valtiontilintarkastajilla on oikeus käyttää asiantuntija-apua ja nimittää kansliaan muita virkamiehiä määräaikaiseen virkasuhteeseen talousarvion rajoissa.

Valtiontilintarkastajat nimittävät kansliansa virkamiehet ja myöntävät heille eron. Valtiontilintarkastajat voivat tehdä virkamiehen kanssa kirjallisen sopimuksen palvelussuhteessa noudatettavista ehdoista.