Eläkelaitos toimii jakautuneena osastoihin, jotka ovat hallinto-osasto, talousosasto, eläke- ja toimeentuloturvaosasto, terveys- ja toimeentuloturvaosasto, tietohallinto-osasto ja palveluosasto.

Osastossa voi olla alayksikköjä.

Lisätty hallitus ottaa ja vapauttaa toimestaan eläkelaitoksen osastopäällikön, ylilääkärin, ylikamreerin ja apulaisylilääkärin. Mainitut toimihenkilöt voidaan ottaa vasta 14 päivän kuluttua sen jälkeen, kun toimen avoinna olemisesta on ilmoitettu pääkaupungin enimmin levinneissä sanomalehdissä.