Tilastokeskuksen pääjohtajan nimittää tasavallan presidentti valtioneuvoston esityksestä. Johtajan nimittää johtokunta. Viraston muun henkilöstön nimittää tai ottaa pääjohtaja, jollei sitä ole työjärjestyksessä annettu muun virkamiehen ratkaistavaksi.

Johtokunta nimittää tilastokeskuksen pääjohtajan esityksestä tämän sijaisena toimivan virkamiehen.