Puheenjohtajana on maaherra ja hänen henkilökohtaisena varamiehenään maaherran sijaisena toimiva lääninhallituksen virkamies, joka maaherran estyneenä ollessa toimii puheenjohtajana. Muut jäsenet ja heidän henkilökohtaiset varamiehensä nimeää valtioneuvosto eduskunnan vaalikaudeksi kerrallaan ottaen huomioon läänin poliittiset voimasuhteet ja lääneissä, joihin kuuluu erikielisiä tai kaksikielisiä kuntia, molempien kieliryhmien edustuksen sekä maakunnittaisen ja muun alueellisen edustavuuden. Lapin läänissä neuvottelukunnan jäsenistä yhden tulee olla saamelaisvaltuuskunnan nimeämä.

Jos lääninrajoja tarkistetaan kesken neuvottelukuntien toimikauden, sisäasiainministeriö päättää tarkistuksista aiheutuvista muutoksista neuvottelukuntien kokoonpanoihin.

Jos jäsen tai varamies vaihtuu kesken toimikauden, lääninhallitus nimeää hänen tilalleen uuden jäsenen tai varamiehen jäljellä olevaksi toimikaudeksi.