Hallitukseen kuuluvat jäseninä laitoksen ylijohtaja ja osastonjohtajat, maa- ja metsauml;talousministeriön edustaja, maanmittaushallituksen edustaja sekä laitoksen alaan läheisesti liittyvän tutkimuksen edustaja. Hallituksen puheenjohtajana toimii laitoksen ylijohtaja ja varapuheenjohtajana maa- ja metsauml;talousministeriön edustaja.