Korkeakouluneuvostoon voidaan opetusministeriön päätöksellä perustaa asioiden valmistelua varten jaostoja. Opetusministeriö määrää jaostojen puheenjohtajat ja jäsenet korkeakouluneuvoston esityksestä.

Jaoston puheenjohtajan tulee olla korkeakouluneuvoston jäsen. Jaostojen jäseniksi voidaan määrätä myös korkeakouluneuvostoon kuulumattomia henkilöitä. Jäseniä määrättäessä on huolehdittava siitä, että myös ruotsinkielinen asiantuntemus on jaostoissa edustettuna. Jaosto valitsee keskuudestaan varapuheenjohtajan.

Korkeakouluneuvosto voi siirtää sille kuuluvan tehtävän jaoston hoidettavaksi.

Kun korkeakouluneuvosto on asetettu seuraavaksi kolmivuotiskaudeksi, uuden neuvoston puheenjohtaja kutsuu neuvoston ennen toimikauden alkamista tekemään esityksen neuvoston pääsihteerin ja sihteerien ottamisesta.