Neuvottelukunnan sihteereinä toimivat sisäasiainministeriön lääni- ja kuntaosaston pääsihteeri, erikoistutkija ja ylitarkastaja.

Pääsihteerin nimittää valtioneuvosto sekä erikoistutkijan ja ylitarkastajan sisäasiainministeriö. Virkoja täytettäessä on hankittava neuvottelukunnan lausunto.

Virkojen kelpoisuusvaatimuksista on säädetty erikseen.

Neuvottelukunnan sihteereinä voivat toimia myös neuvottelukunnan ottamat sivutoimiset sihteerit.